Halaw sa bestselling series ni Harlan Coben, sinusundan ng Shelter ang kuwento ni Mickey Bolitar nang mamatay ang ama, na humantong sa pagsisimula ng bagong buhay sa New Jersey. Nang mawala ang isang bagong mag-aaral, napasok si Mickey sa masalimuot na mundong puno ng lihim. Sa tulong nina Spoon at Ema, ibinunyag nila ang isang madilim na underground na maaaring may kasagutan sa mga nawawala.